Com sede em Jacarta, a Lion Air (JT) opera voos para cerca de 40 destinos na Indonésia, bem como outros pontos dentro da Ásia e Oriente Médio. A companhia aérea tem hubs localizados no Aeroporto Internacional Soekarno-Hatta, em Jacarta (CGK), Aeroporto Internacional Juanda, em Surabaya (SUB), Aeroporto Internacional Hang Nadim, em Batam (BTH) e Aeroporto Internacional Sultan Hasanuddin, em Makassar (UPG). A Lion Air opera voos configurados com apenas uma cabine da classe econômica, embora também tenha alguns aviões de duas cabines (Classe executiva e econômica). A companhia aérea também opera algumas subsidiárias, incluindo a Air Batik, Thai Lion Air, Air Malindo, Wings Air e Lion Bizjet.